Corrélation des niveaux de mutations de l’EGFR dans l’ADN tumoral circulant avec les résultats cliniques chez les patients atteints d’adénocarcinome pulmonaire avancé
Introduction
Le cancer du poumon reste une cause majeure de mortalité liée au cancer dans le monde, les carcinomes non à petites cellules (CNPC) représentant la majorité des cas. Parmi les sous-types de CNPC, l’adénocarcinome pulmonaire est le plus fréquent. La découverte des mutations du récepteur du facteur de croissance épidermique (EGFR) comme facteurs clés de l’adénocarcinome pulmonaire a révolutionné les stratégies thérapeutiques, avec les inhibiteurs de tyrosine kinase (ITK) ciblant l’EGFR devenus un pilier du traitement ciblé. Cependant, malgré l’efficacité des ITK, une proportion significative de patients développent une résistance en 9 à 12 mois, soulignant le besoin d’une détection et d’un suivi précis des mutations de l’EGFR.
Les méthodes traditionnelles de détection des mutations de l’EGFR reposent sur des biopsies tissulaires, qui présentent plusieurs limites : hétérogénéité tumorale, difficulté d’obtention d’échantillons après récidive ou métastase, et risques liés aux procédures invasives. La biopsie liquide, notamment l’analyse de l’ADN tumoral circulant (ADNtc), est une alternative non invasive prometteuse. L’ADNtc fournit des informations génétiques tumorales en temps réel, permettant de suivre la réponse au traitement et les mécanismes de résistance plus précocement que l’imagerie ou les biopsies tissulaires.
Plusieurs méthodes de détection moléculaire ont été développées pour l’analyse de l’ADNtc, incluant le système de mutation réfractaire à l’amplification (ARMS), la PCR digitale en gouttelettes (ddPCR) et le séquençage nouvelle génération (NGS). Bien qu’utiles, ces méthodes présentent des limites en termes de sensibilité, disponibilité et applicabilité clinique. Le système de mutation réfractaire à la super-amplification (superARMS), approuvé pour détecter les mutations de l’EGFR dans l’ADNtc plasmatique, reste qualitatif, limitant son utilisation en recherche clinique.
Dans cette étude, nous présentons une méthode reformulée du superARMS (R-superARMS), utilisant la valeur DCt (valeur du seuil de cycle [Ct] mutant – valeur Ct du contrôle interne) générée lors de la PCR pour transformer le superARMS en méthode semi-quantitative. Nous évaluons sa performance dans la détection des mutations de l’EGFR dans l’ADNtc plasmatique et explorons sa corrélation avec les résultats cliniques chez des patients atteints d’adénocarcinome pulmonaire avancé.
Méthodes
Cette étude a été menée au Centre de Cancérologie du Premier Hôpital de l’Université de Jilin à Changchun, en Chine. Quarante-et-un patients atteints d’adénocarcinome pulmonaire avancé (stade IIIB ou IV) ont été inclus entre janvier 2017 et juin 2018. Les critères d’inclusion incluaient un adénocarcinome pulmonaire confirmé histologiquement, un stade avancé, une maladie nouvellement diagnostiquée ou récidivante, l’absence de traitement préalable au moment du prélèvement, et la disponibilité d’échantillons tumoraux et sanguins prélevés dans un intervalle de 14 jours.
Tous les patients ont reçu des ITK de première génération (erlotinib, géfitinib ou icotinib) en monothérapie ou en combinaison avec des antiangiogéniques (bévacizumab ou apatinib) en première ligne. La réponse tumorale a été évaluée selon les critères RECIST 1.1. L’ADNtc plasmatique a été extrait à l’aide du kit AmoyDx, et les mutations de l’EGFR détectées avec le kit superARMS. La valeur DCt a été calculée pour identifier les mutations, avec des seuils définis à 11 pour 19del/L858R/20ins, 8 pour T790M et 12 pour G719X/L861Q/S768I.
La méthode R-superARMS a été développée en utilisant la valeur DCt pour rendre le superARMS semi-quantitatif. Les patients ont été classés selon les niveaux de mutations à l’inclusion et les variations de DCt après un mois de traitement. Le critère principal était la survie sans progression (SSP), le second étant la survie globale (SG). Les analyses statistiques incluaient les courbes de Kaplan-Meier, l’analyse ROC et le test exact de Fisher.
Résultats
La cohorte comprenait 41 patients d’âge moyen 63 ans, majoritairement des femmes (68,3 %) et non-fumeurs. Environ 51,2 % présentaient des métastases extrathoraciques, principalement osseuses et cérébrales. Le taux de concordance des mutations entre tissus et plasma était de 68,3 % (28/41). Les mutations les plus fréquentes étaient 19del (31,7 %) et L858R (29,3 %), avec des mutations rares comme G719X et T790M.
Les niveaux basaux de mutations de l’EGFR dans l’ADNtc influençaient significativement le pronostic. Le seuil optimal de DCt basal était de 8,11. Les patients avec un DCt ≤8,11 présentaient une SG médiane plus longue (non atteinte vs 11,0 mois ; log-rank P = 0,024). Aucune différence significative de SSP n’a été observée, mais une tendance favorable était notée.
Les variations des niveaux de mutations sous traitement corrélaient également avec le pronostic. Les patients avec élimination complète des mutations (groupe MC) après un mois avaient une SG médiane plus longue (non atteinte vs 10,4 mois ; log-rank P = 0,021) et une SSP tendant à être prolongée (non atteinte vs 27,5 mois ; log-rank P = 0,088).
Une variation de DCt >4,89 après un mois était prédictive d’une SG plus longue (non atteinte vs 11,0 mois ; log-rank P = 0,014). Ces résultats suggèrent que les variations des niveaux de mutations pourraient servir d’indicateurs précoces de réponse.
Discussion
Cette étude démontre le potentiel de la méthode R-superARMS pour une détection semi-quantitative des mutations de l’EGFR dans l’ADNtc. L’utilisation de la valeur DCt offre une approche simple, rapide et économique pour surveiller les niveaux mutationnels, permettant une évaluation plus précise de la réponse au traitement et du pronostic.
Les niveaux basaux d’ADNtc et leur évolution sous traitement étaient fortement corrélés aux résultats cliniques. Les patients avec un DCt bas ≤8,11 ou une élimination complète des mutations présentaient une SG prolongée, suggérant que ces paramètres pourraient identifier les répondeurs aux thérapies ciblées. L’analyse quantitative des variations de DCt a permis une détection précoce de l’efficacité thérapeutique, potentiellement utile pour ajuster les stratégies avant la progression radiologique.
Le concept de réponse moléculaire, évaluée par les variations de l’ADNtc, complète les critères d’imagerie. Les patients du groupe MC ou avec une variation de DCt >4,89 présentaient plus de réponses partielles ou de stabilisation tumorale, soutenant l’utilité de la biopsie liquide dans la prédiction des résultats. Cette approche s’aligne avec la classification TNMB (stade TNM par biopsie liquide).
Les limites incluent la petite taille de la cohorte et l’impact potentiel des traitements ultérieurs sur la SG. Néanmoins, cette étude ouvre la voie à des essais cliniques plus larges pour valider l’utilisation du R-superARMS en pratique courante.
Conclusion
La méthode R-superARMS représente une avancée dans la détection et le suivi des mutations de l’EGFR dans l’ADNtc. En fournissant une mesure semi-quantitative, elle améliore la prédiction de la réponse au traitement et du pronostic dans l’adénocarcinome pulmonaire avancé. L’intégration de l’analyse de l’ADNtc en pratique clinique pourrait optimiser les interventions thérapeutiques personnalisées et améliorer la survie des patients.
doi.org/10.1097/CM9.0000000000001760